Графовые подходы широко используются для интерпретации системных биологических данных: геномики, транскриптомики и других. Такие подходы позволяют интегрировать отдельные наблюдения и находить закономерности в данных. В этой лекции мы обсудим один из таких подходов – задачу поиска активного модуля. При этом мы рассмотрим как возникающие алгоритмические проблемы и способы их решения, так и применение этого подхода в рамках реальных биологических исследований.

Алексей Сергушичев, соруководитель магистерской программы «Биоинформатика и системная биология», к.т.н., доцент ФИТиП, сотрудник международной лаборатории «Компьютерные технологии» ИТМО, сотрудник Washington University in St. Louis